Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNH4Q9UQ05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNH4Q9UQ05 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNH4Q9UQ05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNH4Q9UQ05 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms