Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNRC6BQ9UPQ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNRC6BQ9UPQ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNRC6BQ9UPQ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms