Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP25Q9UHP3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP25Q9UHP3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP25Q9UHP3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms