Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNBIP1Q9NSA3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms