Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF12AQ9NP84 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF12AQ9NP84 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms