Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAT1LQ9HCJ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VAT1LQ9HCJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VAT1LQ9HCJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAT1LQ9HCJ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms