Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RABEP2Q9H5N1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP2Q9H5N1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP2Q9H5N1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP2Q9H5N1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms