Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED28Q9H204 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MED28Q9H204 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED28Q9H204 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MED28Q9H204 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms