Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LYSTQ99698 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms