Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CRBNQ96SW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CRBNQ96SW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CRBNQ96SW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CRBNQ96SW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CRBNQ96SW2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms