Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ARAP1Q96P48 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARAP1Q96P48 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.15
ARAP1Q96P48 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
ARAP1Q96P48 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARAP1Q96P48 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ARAP1Q96P48 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms