Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCER1Q8TC90 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
CCER1Q8TC90 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCER1Q8TC90 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCER1Q8TC90 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCER1Q8TC90 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms