Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
OTOP1Q7RTM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP1Q7RTM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP1Q7RTM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms