Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
OTOP1Q7RTM1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
OTOP1Q7RTM1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
OTOP1Q7RTM1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
OTOP1Q7RTM1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
OTOP1Q7RTM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
OTOP1Q7RTM1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
OTOP1Q7RTM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
OTOP1Q7RTM1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
OTOP1Q7RTM1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
OTOP1Q7RTM1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
OTOP1Q7RTM1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
OTOP1Q7RTM1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
OTOP1Q7RTM1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
OTOP1Q7RTM1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
OTOP1Q7RTM1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
OTOP1Q7RTM1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
OTOP1Q7RTM1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
OTOP1Q7RTM1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
OTOP1Q7RTM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
OTOP1Q7RTM1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
OTOP1Q7RTM1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
OTOP1Q7RTM1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
OTOP1Q7RTM1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
OTOP1Q7RTM1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
OTOP1Q7RTM1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
OTOP1Q7RTM1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
OTOP1Q7RTM1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
OTOP1Q7RTM1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
OTOP1Q7RTM1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
OTOP1Q7RTM1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
OTOP1Q7RTM1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
OTOP1Q7RTM1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
OTOP1Q7RTM1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
OTOP1Q7RTM1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
OTOP1Q7RTM1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
OTOP1Q7RTM1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
OTOP1Q7RTM1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
OTOP1Q7RTM1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
OTOP1Q7RTM1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
OTOP1Q7RTM1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
OTOP1Q7RTM1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
OTOP1Q7RTM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
OTOP1Q7RTM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
OTOP1Q7RTM1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
OTOP1Q7RTM1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
OTOP1Q7RTM1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
OTOP1Q7RTM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
OTOP1Q7RTM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
OTOP1Q7RTM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
OTOP1Q7RTM1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
OTOP1Q7RTM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
OTOP1Q7RTM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
OTOP1Q7RTM1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
OTOP1Q7RTM1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
OTOP1Q7RTM1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
OTOP1Q7RTM1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
OTOP1Q7RTM1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
OTOP1Q7RTM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
OTOP1Q7RTM1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
OTOP1Q7RTM1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
OTOP1Q7RTM1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
OTOP1Q7RTM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
OTOP1Q7RTM1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
OTOP1Q7RTM1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
OTOP1Q7RTM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
OTOP1Q7RTM1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
OTOP1Q7RTM1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
OTOP1Q7RTM1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
OTOP1Q7RTM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
OTOP1Q7RTM1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
OTOP1Q7RTM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
OTOP1Q7RTM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
OTOP1Q7RTM1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
OTOP1Q7RTM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
OTOP1Q7RTM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
OTOP1Q7RTM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
OTOP1Q7RTM1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
OTOP1Q7RTM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
OTOP1Q7RTM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
OTOP1Q7RTM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
OTOP1Q7RTM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
OTOP1Q7RTM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
OTOP1Q7RTM1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
OTOP1Q7RTM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
OTOP1Q7RTM1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
OTOP1Q7RTM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
OTOP1Q7RTM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
OTOP1Q7RTM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
OTOP1Q7RTM1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
OTOP1Q7RTM1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
OTOP1Q7RTM1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
OTOP1Q7RTM1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
OTOP1Q7RTM1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
OTOP1Q7RTM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
OTOP1Q7RTM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms