Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LARP1Q6PKG0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LARP1Q6PKG0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LARP1Q6PKG0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms