Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XAF1Q6GPH4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAF1Q6GPH4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAF1Q6GPH4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms