Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FOCADQ5VW36 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOCADQ5VW36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOCADQ5VW36 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOCADQ5VW36 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms