Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRIP1Q5VSL9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
STRIP1Q5VSL9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRIP1Q5VSL9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
STRIP1Q5VSL9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRIP1Q5VSL9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms