Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HS1BP3Q53T59 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HS1BP3Q53T59 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HS1BP3Q53T59 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HS1BP3Q53T59 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms