Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTCH1Q13635 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTCH1Q13635 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTCH1Q13635 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTCH1Q13635 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTCH1Q13635 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
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