Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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PTPRSQ13332 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRSQ13332 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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PTPRSQ13332 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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PTPRSQ13332 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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PTPRSQ13332 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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PTPRSQ13332 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
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PTPRSQ13332 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRSQ13332 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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PTPRSQ13332 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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PTPRSQ13332 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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PTPRSQ13332 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRSQ13332 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRSQ13332 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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PTPRSQ13332 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRSQ13332 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRSQ13332 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRSQ13332 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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PTPRSQ13332 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
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