Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.62
PTPRSQ13332 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRSQ13332 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRSQ13332 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRSQ13332 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRSQ13332 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PTPRSQ13332 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRSQ13332 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRSQ13332 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRSQ13332 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRSQ13332 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRSQ13332 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRSQ13332 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRSQ13332 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRSQ13332 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRSQ13332 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRSQ13332 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRSQ13332 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRSQ13332 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRSQ13332 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRSQ13332 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRSQ13332 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRSQ13332 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRSQ13332 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRSQ13332 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRSQ13332 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRSQ13332 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRSQ13332 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRSQ13332 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRSQ13332 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRSQ13332 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRSQ13332 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRSQ13332 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRSQ13332 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRSQ13332 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRSQ13332 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRSQ13332 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRSQ13332 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRSQ13332 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRSQ13332 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRSQ13332 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTPRSQ13332 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRSQ13332 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRSQ13332 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRSQ13332 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRSQ13332 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRSQ13332 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRSQ13332 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRSQ13332 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRSQ13332 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRSQ13332 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRSQ13332 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRSQ13332 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRSQ13332 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRSQ13332 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRSQ13332 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRSQ13332 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRSQ13332 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRSQ13332 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRSQ13332 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRSQ13332 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
PTPRSQ13332 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
PTPRSQ13332 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRSQ13332 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRSQ13332 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRSQ13332 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRSQ13332 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRSQ13332 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRSQ13332 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRSQ13332 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRSQ13332 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRSQ13332 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRSQ13332 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRSQ13332 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRSQ13332 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRSQ13332 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRSQ13332 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRSQ13332 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRSQ13332 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRSQ13332 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRSQ13332 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRSQ13332 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRSQ13332 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRSQ13332 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRSQ13332 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRSQ13332 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRSQ13332 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRSQ13332 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRSQ13332 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRSQ13332 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRSQ13332 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRSQ13332 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
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