Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX3Q13185 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX3Q13185 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX3Q13185 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms