Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATP7AQ04656 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP7AQ04656 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATP7AQ04656 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ATP7AQ04656 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.5 ms