Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF2Q01130 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF2Q01130 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF2Q01130 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms