Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL30P62888 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL30P62888 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL30P62888 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL30P62888 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL30P62888 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL30P62888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL30P62888 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL30P62888 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL30P62888 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL30P62888 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL30P62888 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL30P62888 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL30P62888 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL30P62888 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL30P62888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL30P62888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL30P62888 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL30P62888 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL30P62888 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL30P62888 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL30P62888 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL30P62888 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL30P62888 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL30P62888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL30P62888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL30P62888 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL30P62888 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL30P62888 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL30P62888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL30P62888 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL30P62888 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL30P62888 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL30P62888 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL30P62888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL30P62888 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL30P62888 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL30P62888 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL30P62888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL30P62888 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL30P62888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL30P62888 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL30P62888 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL30P62888 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL30P62888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL30P62888 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL30P62888 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL30P62888 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL30P62888 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL30P62888 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL30P62888 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL30P62888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms