Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNI2P48788 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNI2P48788 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNI2P48788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNI2P48788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms