Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR2AP24928 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR2AP24928 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR2AP24928 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR2AP24928 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR2AP24928 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms