Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRBP10828 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRBP10828 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRBP10828 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRBP10828 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRBP10828 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRBP10828 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRBP10828 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRBP10828 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRBP10828 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRBP10828 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRBP10828 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRBP10828 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRBP10828 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRBP10828 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRBP10828 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRBP10828 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRBP10828 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRBP10828 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRBP10828 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRBP10828 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRBP10828 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRBP10828 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRBP10828 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRBP10828 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRBP10828 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRBP10828 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRBP10828 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRBP10828 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRBP10828 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRBP10828 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRBP10828 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRBP10828 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THRBP10828 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRBP10828 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRBP10828 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRBP10828 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRBP10828 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRBP10828 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRBP10828 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THRBP10828 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRBP10828 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRBP10828 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRBP10828 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRBP10828 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRBP10828 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRBP10828 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRBP10828 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THRBP10828 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRBP10828 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRBP10828 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRBP10828 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRBP10828 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THRBP10828 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRBP10828 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRBP10828 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRBP10828 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRBP10828 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRBP10828 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRBP10828 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRBP10828 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRBP10828 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRBP10828 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRBP10828 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRBP10828 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THRBP10828 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRBP10828 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRBP10828 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRBP10828 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRBP10828 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRBP10828 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRBP10828 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRBP10828 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRBP10828 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRBP10828 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
THRBP10828 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRBP10828 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms