Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPO95166 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPO95166 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPO95166 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms