Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CAPN15O75808 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPN15O75808 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN15O75808 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN15O75808 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms