Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
VGFO15240 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
VGFO15240 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
VGFO15240 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
VGFO15240 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
VGFO15240 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
VGFO15240 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
VGFO15240 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
VGFO15240 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
VGFO15240 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
VGFO15240 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
VGFO15240 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
VGFO15240 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
VGFO15240 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
VGFO15240 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
VGFO15240 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
VGFO15240 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VGFO15240 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VGFO15240 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VGFO15240 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
VGFO15240 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
VGFO15240 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
VGFO15240 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
VGFO15240 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
VGFO15240 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
VGFO15240 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
VGFO15240 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
VGFO15240 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
VGFO15240 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
VGFO15240 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
VGFO15240 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
VGFO15240 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
VGFO15240 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
VGFO15240 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
VGFO15240 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VGFO15240 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VGFO15240 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VGFO15240 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
VGFO15240 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
VGFO15240 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
VGFO15240 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
VGFO15240 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
VGFO15240 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
VGFO15240 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
VGFO15240 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
VGFO15240 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
VGFO15240 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
VGFO15240 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
VGFO15240 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
VGFO15240 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VGFO15240 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VGFO15240 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
VGFO15240 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
VGFO15240 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
VGFO15240 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VGFO15240 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VGFO15240 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
VGFO15240 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
VGFO15240 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
VGFO15240 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
VGFO15240 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
VGFO15240 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
VGFO15240 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
VGFO15240 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
VGFO15240 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
VGFO15240 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
VGFO15240 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
VGFO15240 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
VGFO15240 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
VGFO15240 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
VGFO15240 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
VGFO15240 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
VGFO15240 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
VGFO15240 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VGFO15240 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
VGFO15240 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
VGFO15240 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
VGFO15240 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
VGFO15240 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
VGFO15240 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
VGFO15240 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
VGFO15240 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
VGFO15240 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
VGFO15240 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
VGFO15240 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
VGFO15240 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
VGFO15240 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
VGFO15240 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
VGFO15240 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
VGFO15240 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VGFO15240 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
VGFO15240 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
VGFO15240 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms