Protein–RNA interactions for Protein: O00159

MYO1C, Unconventional myosin-Ic, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1CO00159 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1CO00159 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1CO00159 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1CO00159 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYO1CO00159 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms