Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L3A6NEY3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA6L3A6NEY3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOLGA6L3A6NEY3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA6L3A6NEY3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms