Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF222A6NCQ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF222A6NCQ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF222A6NCQ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF222A6NCQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF222A6NCQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF222A6NCQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF222A6NCQ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF222A6NCQ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF222A6NCQ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms