Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 INTS10-203ENST00000518424 556 ntTSL 416.87■□□□□ 0.292e-17■■■■■ 31.9
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PRPF8Q6P2Q9 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.267e-7■■■■■ 31.8
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PRPF8Q6P2Q9 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 31.8
PRPF8Q6P2Q9 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.24□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 31.8
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