RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541213.5

POLE-216, Transcript of DNA polymerase epsilon, catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene POLE, Length 1,675 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE-216ENST00000541213 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.58■■■■■ 5.85
POLE-216ENST00000541213 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.19■■■■■ 4.83
POLE-216ENST00000541213 ABCC9O60706 1549 aa43.21■■■■■ 4.51
POLE-216ENST00000541213 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
POLE-216ENST00000541213 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.82■■■■■ 4.44
POLE-216ENST00000541213 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.71■■■■■ 4.43
POLE-216ENST00000541213 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.44■■■■■ 4.38
POLE-216ENST00000541213 NACADO15069 1562 aa42.3■■■■■ 4.36
POLE-216ENST00000541213 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.04■■■■■ 4.32
POLE-216ENST00000541213 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.6■■■■■ 4.25
POLE-216ENST00000541213 SCRIBQ14160 1630 aa41.41■■■■■ 4.22
POLE-216ENST00000541213 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.95■■■■■ 4.15
POLE-216ENST00000541213 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.69■■■■■ 4.1
POLE-216ENST00000541213 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.68■■■■■ 4.18e-11■■■■■ 38.9
POLE-216ENST00000541213 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.07■■■■■ 4.01
POLE-216ENST00000541213 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
POLE-216ENST00000541213 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
POLE-216ENST00000541213 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
POLE-216ENST00000541213 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.78■■■■□ 3.96
POLE-216ENST00000541213 SMARCA4P51532 1647 aa39.71■■■■□ 3.95
POLE-216ENST00000541213 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
POLE-216ENST00000541213 WIZO95785 1651 aa39.37■■■■□ 3.89
POLE-216ENST00000541213 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.3■■■■□ 3.88
POLE-216ENST00000541213 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.26■■■■□ 3.88
POLE-216ENST00000541213 SMARCA2P51531 1590 aa39.25■■■■□ 3.87
POLE-216ENST00000541213 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.08■■■■□ 3.85
POLE-216ENST00000541213 NCAPD3P42695 1498 aa39.07■■■■□ 3.85
POLE-216ENST00000541213 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
POLE-216ENST00000541213 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.83
POLE-216ENST00000541213 HMGXB3Q12766 1538 aa38.92■■■■□ 3.82
POLE-216ENST00000541213 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.63■■■■□ 3.77
POLE-216ENST00000541213 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.61■■■■□ 3.77
POLE-216ENST00000541213 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.04■■■■□ 3.68
POLE-216ENST00000541213 CFTRP13569 1480 aa38.03■■■■□ 3.68
POLE-216ENST00000541213 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.87■■■■□ 3.65
POLE-216ENST00000541213 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.79■■■■□ 3.64
POLE-216ENST00000541213 NESP48681 1621 aa37.73■■■■□ 3.63
POLE-216ENST00000541213 PRDM2Q13029 1718 aa37.62■■■■□ 3.61
POLE-216ENST00000541213 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.58■■■■□ 3.61
POLE-216ENST00000541213 TRIM41Q8WV44 630 aa37.58■■■■□ 3.61
POLE-216ENST00000541213 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.56■■■■□ 3.6
POLE-216ENST00000541213 ABCC8Q09428 1581 aa37.55■■■■□ 3.6
POLE-216ENST00000541213 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.51■■■■□ 3.6
POLE-216ENST00000541213 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.38■■■■□ 3.57
POLE-216ENST00000541213 SYNJ1O43426 1573 aa37.26■■■■□ 3.55
POLE-216ENST00000541213 CUX1P39880 1505 aa37.22■■■■□ 3.55
POLE-216ENST00000541213 TOP2BQ02880 1626 aa37.21■■■■□ 3.55
POLE-216ENST00000541213 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.2■■■■□ 3.55
POLE-216ENST00000541213 ERCC6Q03468 1493 aa37.17■■■■□ 3.54
POLE-216ENST00000541213 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.15■■■■□ 3.54
POLE-216ENST00000541213 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.1■■■■□ 3.53
POLE-216ENST00000541213 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
POLE-216ENST00000541213 TOPBP1Q92547 1522 aa37.06■■■■□ 3.52
POLE-216ENST00000541213 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.06■■■■□ 3.52
POLE-216ENST00000541213 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.93■■■■□ 3.5
POLE-216ENST00000541213 WDR62O43379 1518 aa36.86■■■■□ 3.49
POLE-216ENST00000541213 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
POLE-216ENST00000541213 SOGA1O94964 1423 aa36.8■■■■□ 3.48
POLE-216ENST00000541213 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
POLE-216ENST00000541213 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
POLE-216ENST00000541213 EEA1Q15075 1411 aa36.76■■■■□ 3.47
POLE-216ENST00000541213 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.7■■■■□ 3.46
POLE-216ENST00000541213 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.66■■■■□ 3.46
POLE-216ENST00000541213 KIF27Q86VH2 1401 aa36.65■■■■□ 3.46
POLE-216ENST00000541213 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.64■■■■□ 3.46
POLE-216ENST00000541213 CUX2O14529 1486 aa36.61■■■■□ 3.45
POLE-216ENST00000541213 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.6■■■■□ 3.45
POLE-216ENST00000541213 IFT140Q96RY7 1462 aa36.56■■■■□ 3.44
POLE-216ENST00000541213 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
POLE-216ENST00000541213 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
POLE-216ENST00000541213 WDR97A6NE52 1622 aa36.43■■■■□ 3.42
POLE-216ENST00000541213 IGF1RP08069 1367 aa36.36■■■■□ 3.41
POLE-216ENST00000541213 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.35■■■■□ 3.41
POLE-216ENST00000541213 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.35■■■■□ 3.41
POLE-216ENST00000541213 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.3■■■■□ 3.4
POLE-216ENST00000541213 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
POLE-216ENST00000541213 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.27■■■■□ 3.47e-7■■■■□ 26
POLE-216ENST00000541213 PRXQ9BXM0 1461 aa36.22■■■■□ 3.39
POLE-216ENST00000541213 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.21■■■■□ 3.39
POLE-216ENST00000541213 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.21■■■■□ 3.39
POLE-216ENST00000541213 KIF21BO75037 1637 aa36.18■■■■□ 3.38
POLE-216ENST00000541213 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.18■■■■□ 3.38
POLE-216ENST00000541213 GRIN2BQ13224 1484 aa36.16■■■■□ 3.38
POLE-216ENST00000541213 GOLGA3Q08378 1498 aa36.15■■■■□ 3.38
POLE-216ENST00000541213 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
POLE-216ENST00000541213 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.08■■■■□ 3.37
POLE-216ENST00000541213 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
POLE-216ENST00000541213 CUL7Q14999 1698 aa36.06■■■■□ 3.36
POLE-216ENST00000541213 PBRM1Q86U86 1689 aa36.03■■■■□ 3.36
POLE-216ENST00000541213 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.97■■■■□ 3.35
POLE-216ENST00000541213 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.97■■■■□ 3.35
POLE-216ENST00000541213 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.93■■■■□ 3.34
POLE-216ENST00000541213 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
POLE-216ENST00000541213 ADAMTS12P58397 1594 aa35.88■■■■□ 3.33
POLE-216ENST00000541213 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
POLE-216ENST00000541213 SYNJ2O15056 1496 aa35.77■■■■□ 3.32
POLE-216ENST00000541213 FBLN2P98095 1184 aa35.7■■■■□ 3.31
POLE-216ENST00000541213 GRIN2AQ12879 1464 aa35.68■■■■□ 3.3
POLE-216ENST00000541213 CEP162Q5TB80 1403 aa35.67■■■■□ 3.3
POLE-216ENST00000541213 CLIP1P30622 1438 aa35.55■■■■□ 3.28
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