Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZBTB8OS-208ENST00000468695 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.661e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-212ENST00000479075 769 ntTSL 510.72□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-206ENST00000466361 538 ntTSL 28.59□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 MAPK14-205ENST00000472333 585 ntTSL 57.07□□□□□ -1.282e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 MAPK14-208ENST00000491957 2777 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-214ENST00000492007 817 ntTSL 36.74□□□□□ -1.331e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 MAPK14-209ENST00000496250 2750 ntTSL 1 (best)6.6□□□□□ -1.352e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-213ENST00000483138 680 ntTSL 35.9□□□□□ -1.461e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-211ENST00000476493 588 ntTSL 55.32□□□□□ -1.561e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-203ENST00000373506 766 ntTSL 34.77□□□□□ -1.651e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-209ENST00000473294 620 ntTSL 54.52□□□□□ -1.691e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.721e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.721e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 STRN3-204ENST00000554124 785 ntTSL 43.62□□□□□ -1.831e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.881e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 ZBTB8OS-204ENST00000436661 514 ntTSL 1 (best)3.23□□□□□ -1.891e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.888e-8■■□□□ 13
ILF3Q12906 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.498e-8■■□□□ 13
ILF3Q12906 CERS4-207ENST00000558877 758 ntTSL 313.3□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.093e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.443e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.533e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 HELLS-203ENST00000371327 4987 ntTSL 23.74□□□□□ -1.815e-8■■□□□ 13
ILF3Q12906 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 515.03■□□□□ -02e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 514.88□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 511.53□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 AARS-203ENST00000565361 839 ntTSL 511.78□□□□□ -0.524e-12■■□□□ 13
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ILF3Q12906 PAPD4-215ENST00000514095 575 ntTSL 414.69□□□□□ -0.067e-10■■□□□ 13
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ILF3Q12906 PAPD4-217ENST00000515807 576 ntTSL 412.38□□□□□ -0.437e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 PAPD4-207ENST00000504233 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.757e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 PAPD4-201ENST00000296783 3129 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.847e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.987e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.077e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 PAPD4-206ENST00000503620 582 ntTSL 38.12□□□□□ -1.117e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.457e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 PAPD4-209ENST00000505571 781 ntTSL 34.11□□□□□ -1.757e-10■■□□□ 13
ILF3Q12906 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.143e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)21.78■■□□□ 1.083e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.563e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 CDC14B-204ENST00000412285 5271 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.893e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 XIAP-203ENST00000422098 390 ntTSL 423.29■■□□□ 1.327e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 XIAP-206ENST00000468503 157 ntTSL 313.47□□□□□ -0.257e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 XIAP-204ENST00000430625 528 ntTSL 32.23□□□□□ -2.057e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.136e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 VPS13D-202ENST00000460333 4910 ntTSL 25.86□□□□□ -1.472e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.612e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.612e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 MKL2-207ENST00000573051 1938 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-9■■□□□ 13
ILF3Q12906 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.131e-9■■□□□ 13
ILF3Q12906 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-9■■□□□ 13
ILF3Q12906 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.291e-9■■□□□ 13
ILF3Q12906 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.361e-9■■□□□ 13
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ILF3Q12906 MKL2-212ENST00000575768 389 ntTSL 33.21□□□□□ -1.91e-9■■□□□ 13
ILF3Q12906 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.472e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 417.68■□□□□ 0.422e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 13
ILF3Q12906 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■■□□□ 13
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ILF3Q12906 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 214.51□□□□□ -0.097e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.237e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.267e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.277e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.487e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.547e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.687e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.887e-11■■□□□ 13
ILF3Q12906 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 29.33□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 29.31□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 26.5□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 13
ILF3Q12906 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.396e-7■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.36e-7■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 RERE-208ENST00000465125 396 ntTSL 524.09■■□□□ 1.459e-7■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 RERE-215ENST00000492766 367 ntTSL 313.45□□□□□ -0.269e-7■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 RERE-205ENST00000460659 454 ntTSL 210.25□□□□□ -0.779e-7■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 RERE-214ENST00000488215 962 ntTSL 39.75□□□□□ -0.859e-7■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 CYP2F2P-202ENST00000641827 1004 ntBASIC9.81□□□□□ -0.841e-6■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.57e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-205ENST00000593431 582 ntTSL 319.24■□□□□ 0.677e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-208ENST00000595881 2681 ntTSL 218.67■□□□□ 0.587e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.447e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-214ENST00000598927 1616 ntTSL 517.69■□□□□ 0.427e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-203ENST00000452439 1351 ntTSL 217.58■□□□□ 0.47e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.377e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-209ENST00000596147 383 ntTSL 317.24■□□□□ 0.357e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.317e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-215ENST00000598936 870 ntTSL 316.36■□□□□ 0.217e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-212ENST00000598319 1888 ntTSL 515.99■□□□□ 0.157e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-206ENST00000594823 819 ntTSL 515.14■□□□□ 0.017e-8■■□□□ 12.9
ILF3Q12906 FCGRT-211ENST00000598076 676 ntTSL 313.54□□□□□ -0.247e-8■■□□□ 12.9
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