Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 WAC-210ENST00000439676 2762 ntTSL 54.85□□□□□ -1.632e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-201ENST00000345541 4526 ntTSL 1 (best)4.02□□□□□ -1.772e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 PRR14L-202ENST00000330495 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.167e-8■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.497e-8■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.256e-7■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.66e-7■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-16■■■□□ 16.4
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TARDBPQ13148 USP36-224ENST00000592907 543 ntTSL 224.04■■□□□ 1.447e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 USP36-209ENST00000587783 679 ntTSL 322.19■■□□□ 1.147e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 USP36-220ENST00000591942 564 ntTSL 521.95■■□□□ 1.17e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.937e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 USP36-212ENST00000588365 546 ntTSL 420.81■□□□□ 0.927e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.837e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 USP36-222ENST00000592275 594 ntTSL 414.56□□□□□ -0.087e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 USP36-206ENST00000586896 696 ntTSL 514.12□□□□□ -0.157e-9■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 MARCH3-205ENST00000515241 719 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 ARID1A-208ENST00000532781 2583 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.321e-17■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 211.53□□□□□ -0.561e-17■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 ARID1A-212ENST00000636219 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.92□□□□□ -0.661e-17■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt10.34□□□□□ -0.751e-17■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 APTX-232ENST00000495360 1313 ntTSL 517.45■□□□□ 0.381e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 APTX-210ENST00000460945 542 ntTSL 416.62■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 214.31□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 TTYH2-204ENST00000528128 532 ntTSL 412.94□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 TTYH2-201ENST00000269346 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 TTYH2-208ENST00000534346 546 ntTSL 410.77□□□□□ -0.693e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 513.42□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.54e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.244e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.234e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 216.19■□□□□ 0.184e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-11■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)10.78□□□□□ -0.684e-11■■■□□ 16.4
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TARDBPQ13148 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.795e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.975e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.165e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.185e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.215e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.255e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.198e-7■■■□□ 16.3
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TARDBPQ13148 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.269e-7■■■□□ 16.3
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TARDBPQ13148 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.619e-7■■■□□ 16.3
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TARDBPQ13148 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 16.3
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TARDBPQ13148 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 YES1-204ENST00000581960 487 ntTSL 325.1■■□□□ 1.614e-7■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 YES1-202ENST00000577611 568 ntTSL 420.28■□□□□ 0.844e-7■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.974e-7■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.294e-7■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 FAM208B-204ENST00000463468 560 ntTSL 35.31□□□□□ -1.561e-8■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 FAM208B-208ENST00000482419 424 ntTSL 25.19□□□□□ -1.581e-8■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.313e-7■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 MAP3K4-213ENST00000542952 629 ntTSL 415.53■□□□□ 0.082e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 MAP3K4-215ENST00000544041 5444 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.262e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 MAP3K4-207ENST00000490904 5451 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.282e-11■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 WDR74-208ENST00000538098 548 ntTSL 417.58■□□□□ 0.43e-12■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-12■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-9■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 PGRMC2-205ENST00000509070 430 ntTSL 214.61□□□□□ -0.073e-9■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.463e-9■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.53e-9■■■□□ 16.3
TARDBPQ13148 USP22-204ENST00000476111 573 ntTSL 318.64■□□□□ 0.571e-7■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 USP22-209ENST00000579645 1906 ntTSL 517.94■□□□□ 0.461e-7■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.281e-7■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-7■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 USP22-211ENST00000584538 554 ntTSL 411.54□□□□□ -0.561e-7■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 USP22-202ENST00000455117 677 ntTSL 510.36□□□□□ -0.751e-7■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 216.19■□□□□ 0.185e-11■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.15e-11■■■□□ 16.2
TARDBPQ13148 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 515.18■□□□□ 0.025e-11■■■□□ 16.2
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