Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR4A1P22736 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms