RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407022.7

BSCL2-207, Transcript of BSCL2, seipin lipid droplet biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene BSCL2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2-207ENST00000407022 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.69■■■■■ 5.07
BSCL2-207ENST00000407022 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.16■■■■■ 4.18
BSCL2-207ENST00000407022 ABCC9O60706 1549 aa39.33■■■■□ 3.89
BSCL2-207ENST00000407022 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
BSCL2-207ENST00000407022 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.67■■■■□ 3.78
BSCL2-207ENST00000407022 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.49■■■■□ 3.75
BSCL2-207ENST00000407022 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.43■■■■□ 3.74
BSCL2-207ENST00000407022 NACADO15069 1562 aa38.4■■■■□ 3.74
BSCL2-207ENST00000407022 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.21■■■■□ 3.71
BSCL2-207ENST00000407022 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.63■■■■□ 3.61
BSCL2-207ENST00000407022 SCRIBQ14160 1630 aa37.61■■■■□ 3.61
BSCL2-207ENST00000407022 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.37■■■■□ 3.57
BSCL2-207ENST00000407022 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.19■■■■□ 3.54
BSCL2-207ENST00000407022 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.86■■■■□ 3.494e-8■■■□□ 17.5
BSCL2-207ENST00000407022 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.32■■■■□ 3.4
BSCL2-207ENST00000407022 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
BSCL2-207ENST00000407022 SMARCA4P51532 1647 aa36.08■■■■□ 3.37
BSCL2-207ENST00000407022 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
BSCL2-207ENST00000407022 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.05■■■■□ 3.36
BSCL2-207ENST00000407022 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
BSCL2-207ENST00000407022 WIZO95785 1651 aa35.74■■■■□ 3.31
BSCL2-207ENST00000407022 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.72■■■■□ 3.31
BSCL2-207ENST00000407022 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.69■■■■□ 3.3
BSCL2-207ENST00000407022 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.6■■■■□ 3.29
BSCL2-207ENST00000407022 SMARCA2P51531 1590 aa35.56■■■■□ 3.28
BSCL2-207ENST00000407022 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
BSCL2-207ENST00000407022 NCAPD3P42695 1498 aa35.43■■■■□ 3.26
BSCL2-207ENST00000407022 HMGXB3Q12766 1538 aa35.36■■■■□ 3.25
BSCL2-207ENST00000407022 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.35■■■■□ 3.25
BSCL2-207ENST00000407022 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
BSCL2-207ENST00000407022 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
BSCL2-207ENST00000407022 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.91■■■■□ 3.18
BSCL2-207ENST00000407022 CFTRP13569 1480 aa34.44■■■■□ 3.1
BSCL2-207ENST00000407022 PRDM2Q13029 1718 aa34.41■■■■□ 3.1
BSCL2-207ENST00000407022 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.4■■■■□ 3.1
BSCL2-207ENST00000407022 NESP48681 1621 aa34.37■■■■□ 3.09
BSCL2-207ENST00000407022 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.36■■■■□ 3.09
BSCL2-207ENST00000407022 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.06■■■■□ 3.04
BSCL2-207ENST00000407022 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.02■■■■□ 3.04
BSCL2-207ENST00000407022 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.98■■■■□ 3.03
BSCL2-207ENST00000407022 ABCC8Q09428 1581 aa33.97■■■■□ 3.03
BSCL2-207ENST00000407022 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.88■■■■□ 3.01
BSCL2-207ENST00000407022 SYNJ1O43426 1573 aa33.78■■■■□ 3
BSCL2-207ENST00000407022 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.78■■■■□ 3
BSCL2-207ENST00000407022 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.77■■■■□ 3
BSCL2-207ENST00000407022 CUX1P39880 1505 aa33.76■■■■□ 3
BSCL2-207ENST00000407022 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.72■■■□□ 2.99
BSCL2-207ENST00000407022 ERCC6Q03468 1493 aa33.72■■■□□ 2.99
BSCL2-207ENST00000407022 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
BSCL2-207ENST00000407022 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
BSCL2-207ENST00000407022 TOP2BQ02880 1626 aa33.69■■■□□ 2.98
BSCL2-207ENST00000407022 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.66■■■□□ 2.98
BSCL2-207ENST00000407022 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.66■■■□□ 2.98
BSCL2-207ENST00000407022 TOPBP1Q92547 1522 aa33.63■■■□□ 2.97
BSCL2-207ENST00000407022 WDR62O43379 1518 aa33.59■■■□□ 2.97
BSCL2-207ENST00000407022 TRIM41Q8WV44 630 aa33.49■■■□□ 2.95
BSCL2-207ENST00000407022 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.45■■■□□ 2.94
BSCL2-207ENST00000407022 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
BSCL2-207ENST00000407022 CUX2O14529 1486 aa33.32■■■□□ 2.92
BSCL2-207ENST00000407022 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
BSCL2-207ENST00000407022 WDR97A6NE52 1622 aa33.27■■■□□ 2.92
BSCL2-207ENST00000407022 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.25■■■□□ 2.91
BSCL2-207ENST00000407022 SOGA1O94964 1423 aa33.2■■■□□ 2.91
BSCL2-207ENST00000407022 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.16■■■□□ 2.9
BSCL2-207ENST00000407022 IFT140Q96RY7 1462 aa33.11■■■□□ 2.89
BSCL2-207ENST00000407022 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.1■■■□□ 2.89
BSCL2-207ENST00000407022 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.03■■■□□ 2.88
BSCL2-207ENST00000407022 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
BSCL2-207ENST00000407022 KIF27Q86VH2 1401 aa32.94■■■□□ 2.86
BSCL2-207ENST00000407022 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
BSCL2-207ENST00000407022 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
BSCL2-207ENST00000407022 EEA1Q15075 1411 aa32.9■■■□□ 2.86
BSCL2-207ENST00000407022 PBRM1Q86U86 1689 aa32.88■■■□□ 2.85
BSCL2-207ENST00000407022 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.88■■■□□ 2.859e-8■■■■■ 70.8
BSCL2-207ENST00000407022 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.87■■■□□ 2.85
BSCL2-207ENST00000407022 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
BSCL2-207ENST00000407022 IGF1RP08069 1367 aa32.77■■■□□ 2.84
BSCL2-207ENST00000407022 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.77■■■□□ 2.84
BSCL2-207ENST00000407022 GRIN2BQ13224 1484 aa32.72■■■□□ 2.83
BSCL2-207ENST00000407022 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.72■■■□□ 2.83
BSCL2-207ENST00000407022 CUL7Q14999 1698 aa32.67■■■□□ 2.82
BSCL2-207ENST00000407022 PRXQ9BXM0 1461 aa32.65■■■□□ 2.82
BSCL2-207ENST00000407022 KIF21BO75037 1637 aa32.64■■■□□ 2.81
BSCL2-207ENST00000407022 ADAMTS12P58397 1594 aa32.62■■■□□ 2.81
BSCL2-207ENST00000407022 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.59■■■□□ 2.81
BSCL2-207ENST00000407022 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
BSCL2-207ENST00000407022 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.55■■■□□ 2.8
BSCL2-207ENST00000407022 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.51■■■□□ 2.79
BSCL2-207ENST00000407022 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.49■■■□□ 2.79
BSCL2-207ENST00000407022 GOLGA3Q08378 1498 aa32.42■■■□□ 2.78
BSCL2-207ENST00000407022 SYNJ2O15056 1496 aa32.41■■■□□ 2.78
BSCL2-207ENST00000407022 CHD1O14646 1710 aa32.4■■■□□ 2.78
BSCL2-207ENST00000407022 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.4■■■□□ 2.78
BSCL2-207ENST00000407022 GRIN2AQ12879 1464 aa32.34■■■□□ 2.77
BSCL2-207ENST00000407022 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.31■■■□□ 2.76
BSCL2-207ENST00000407022 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.26■■■□□ 2.75
BSCL2-207ENST00000407022 CEP170Q5SW79 1584 aa32.22■■■□□ 2.75
BSCL2-207ENST00000407022 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
BSCL2-207ENST00000407022 NUP160Q12769 1436 aa32.18■■■□□ 2.74
BSCL2-207ENST00000407022 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.2 ms