Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PEMTQ9UBM1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PEMTQ9UBM1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms