Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms