Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 C11orf49-209ENST00000526424 556 ntTSL 49.81□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 26.8
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PCBP2Q15366 C11orf49-218ENST00000532633 597 ntTSL 47.82□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 26.8
PCBP2Q15366 CHERP-202ENST00000544299 1755 ntTSL 217.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 26.8
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PCBP2Q15366 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 26.8
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PCBP2Q15366 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.362e-8■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.394e-7■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 SLC38A9-207ENST00000503891 541 ntTSL 46.81□□□□□ -1.328e-7■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.748e-7■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 EHMT1-229ENST00000636081 100 ntTSL 53.04□□□□□ -1.928e-7■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.58e-10■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 TMEM8A-208ENST00000476735 801 ntTSL 516.76■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.221e-9■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.751e-9■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.751e-9■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.751e-9■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-9■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-9■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 MTHFD2-204ENST00000462026 599 ntTSL 511.22□□□□□ -0.613e-13■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 MTHFD2-206ENST00000477455 696 ntTSL 37.83□□□□□ -1.163e-13■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-206ENST00000419113 654 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-10■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.052e-10■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.071e-9■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.11e-9■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.327e-8■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.652e-7■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 58.19□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 26.7
PCBP2Q15366 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.22e-7■■■■□ 26.7
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PCBP2Q15366 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.385e-15■■■■□ 26.6
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PCBP2Q15366 HDAC10-203ENST00000415993 2375 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.315e-15■■■■□ 26.6
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PCBP2Q15366 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 215.75■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-11■■■■□ 26.6
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PCBP2Q15366 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.83e-8■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.875e-8■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 SGTA-205ENST00000591984 882 ntTSL 211.29□□□□□ -0.65e-8■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.216e-28■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 MMD-202ENST00000571578 670 ntTSL 316.27■□□□□ 0.26e-28■■■■□ 26.6
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PCBP2Q15366 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-11■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 PHTF2-203ENST00000307305 4793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-11■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.861e-11■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.471e-11■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.551e-11■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.851e-11■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.921e-11■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-220ENST00000532999 1341 ntTSL 513.82□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-208ENST00000526283 2004 ntTSL 513.74□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-205ENST00000525693 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 RELA-217ENST00000531484 2251 ntTSL 210.13□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.026e-8■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.116e-8■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 26.6
PCBP2Q15366 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 26.6
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