RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452157.5

MIER3-208, Transcript of MIER family member 3, human

TSL 1 (best)

Gene MIER3, Length 5,240 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIER3-208	ENST00000452157	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MIER3-208	ENST00000452157	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MIER3-208	ENST00000452157	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		5.71	□□□□□ -1.49
MIER3-208	ENST00000452157	MYT1	Q01538	1121 aa		5.71	□□□□□ -1.5
MIER3-208	ENST00000452157	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
MIER3-208	ENST00000452157	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MIER3-208	ENST00000452157	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
MIER3-208	ENST00000452157	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MIER3-208	ENST00000452157	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
MIER3-208	ENST00000452157	NEFL	P07196	543 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIER3-208	ENST00000452157	APLP2	Q06481	763 aa		5.35	□□□□□ -1.55
MIER3-208	ENST00000452157	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		5.31	□□□□□ -1.56
MIER3-208	ENST00000452157	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MIER3-208	ENST00000452157	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MIER3-208	ENST00000452157	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MIER3-208	ENST00000452157	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MIER3-208	ENST00000452157	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MIER3-208	ENST00000452157	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MIER3-208	ENST00000452157	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MIER3-208	ENST00000452157	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MIER3-208	ENST00000452157	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MIER3-208	ENST00000452157	NEFM	P07197	916 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MIER3-208	ENST00000452157	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MIER3-208	ENST00000452157	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MIER3-208	ENST00000452157	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIER3-208	ENST00000452157	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MIER3-208	ENST00000452157	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIER3-208	ENST00000452157	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MIER3-208	ENST00000452157	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIER3-208	ENST00000452157	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIER3-208	ENST00000452157	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIER3-208	ENST00000452157	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIER3-208	ENST00000452157	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIER3-208	ENST00000452157	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIER3-208	ENST00000452157	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MIER3-208	ENST00000452157	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIER3-208	ENST00000452157	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MIER3-208	ENST00000452157	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MIER3-208	ENST00000452157	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MIER3-208	ENST00000452157	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MIER3-208	ENST00000452157	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MIER3-208	ENST00000452157	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MIER3-208	ENST00000452157	SLC24A1	O60721	1099 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIER3-208	ENST00000452157	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MIER3-208	ENST00000452157	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MIER3-208	ENST00000452157	NRDC	O43847	1150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	PTMS	P20962	102 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
MIER3-208	ENST00000452157	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	ANP32C	O43423	234 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	BECN1	Q14457	450 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	TRIM41	Q8WV44	630 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	POTED	Q86YR6	584 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MIER3-208	ENST00000452157	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	CLSTN1	O94985	981 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	HRC	P23327	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	ITGAE	P38570	1179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	HMMR	O75330	724 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	APP	P05067	770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MIER3-208	ENST00000452157	NEFH	P12036	1026 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MIER3-208	ENST00000452157	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MIER3-208	ENST00000452157	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MIER3-208	ENST00000452157	FKBP8	Q14318	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIER3-208	ENST00000452157	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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