RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374548.5

EDA-202, Transcript of ectodysplasin A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EDA, Length 1,116 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDA-202ENST00000374548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.82■■■■■ 7.65
EDA-202ENST00000374548 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56■■■■■ 6.55
EDA-202ENST00000374548 ABCC9O60706 1549 aa55.34■■■■■ 6.45
EDA-202ENST00000374548 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.99■■■■■ 6.07
EDA-202ENST00000374548 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.94■■■■■ 6.07
EDA-202ENST00000374548 NACADO15069 1562 aa52.79■■■■■ 6.04
EDA-202ENST00000374548 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.25■■■■■ 5.96
EDA-202ENST00000374548 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.21■■■■■ 5.95
EDA-202ENST00000374548 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.89■■■■■ 5.9
EDA-202ENST00000374548 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.7■■■■■ 5.87
EDA-202ENST00000374548 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.69■■■■■ 5.87
EDA-202ENST00000374548 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.32■■■■■ 5.81
EDA-202ENST00000374548 SCRIBQ14160 1630 aa51.16■■■■■ 5.78
EDA-202ENST00000374548 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.14■■■■■ 5.78
EDA-202ENST00000374548 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.74■■■■■ 5.71
EDA-202ENST00000374548 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
EDA-202ENST00000374548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.98■■■■■ 5.59
EDA-202ENST00000374548 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.75■■■■■ 5.55
EDA-202ENST00000374548 SMARCA4P51532 1647 aa48.83■■■■■ 5.41
EDA-202ENST00000374548 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.74■■■■■ 5.39
EDA-202ENST00000374548 NCAPD3P42695 1498 aa48.71■■■■■ 5.39
EDA-202ENST00000374548 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.69■■■■■ 5.39
EDA-202ENST00000374548 SMARCA2P51531 1590 aa48.63■■■■■ 5.38
EDA-202ENST00000374548 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.42■■■■■ 5.34
EDA-202ENST00000374548 HMGXB3Q12766 1538 aa48.41■■■■■ 5.34
EDA-202ENST00000374548 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
EDA-202ENST00000374548 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.3■■■■■ 5.32
EDA-202ENST00000374548 WIZO95785 1651 aa47.89■■■■■ 5.26
EDA-202ENST00000374548 ERCC6Q03468 1493 aa47.78■■■■■ 5.24
EDA-202ENST00000374548 NESP48681 1621 aa47.72■■■■■ 5.23
EDA-202ENST00000374548 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
EDA-202ENST00000374548 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.51■■■■■ 5.2
EDA-202ENST00000374548 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
EDA-202ENST00000374548 CUX2O14529 1486 aa47.33■■■■■ 5.17
EDA-202ENST00000374548 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.32■■■■■ 5.17
EDA-202ENST00000374548 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.27■■■■■ 5.16
EDA-202ENST00000374548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.11■■■■■ 5.13
EDA-202ENST00000374548 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
EDA-202ENST00000374548 CFTRP13569 1480 aa46.9■■■■■ 5.1
EDA-202ENST00000374548 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.82■■■■■ 5.09
EDA-202ENST00000374548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.78■■■■■ 5.08
EDA-202ENST00000374548 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.77■■■■■ 5.08
EDA-202ENST00000374548 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.77■■■■■ 5.08
EDA-202ENST00000374548 WDR62O43379 1518 aa46.59■■■■■ 5.05
EDA-202ENST00000374548 PRDM2Q13029 1718 aa46.48■■■■■ 5.03
EDA-202ENST00000374548 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.43■■■■■ 5.02
EDA-202ENST00000374548 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.02
EDA-202ENST00000374548 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
EDA-202ENST00000374548 TOPBP1Q92547 1522 aa45.97■■■■■ 4.95
EDA-202ENST00000374548 ABCC8Q09428 1581 aa45.96■■■■■ 4.95
EDA-202ENST00000374548 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.87■■■■■ 4.93
EDA-202ENST00000374548 IFT140Q96RY7 1462 aa45.8■■■■■ 4.92
EDA-202ENST00000374548 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
EDA-202ENST00000374548 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
EDA-202ENST00000374548 CUX1P39880 1505 aa45.45■■■■■ 4.87
EDA-202ENST00000374548 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
EDA-202ENST00000374548 SOGA1O94964 1423 aa45.42■■■■■ 4.86
EDA-202ENST00000374548 OSCARQ8IYS5 282 aa45.4■■■■■ 4.86
EDA-202ENST00000374548 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
EDA-202ENST00000374548 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.39■■■■■ 4.86
EDA-202ENST00000374548 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.39■■■■■ 4.86
EDA-202ENST00000374548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.35■■■■■ 4.85
EDA-202ENST00000374548 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
EDA-202ENST00000374548 WDR97A6NE52 1622 aa45.06■■■■■ 4.8
EDA-202ENST00000374548 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.05■■■■■ 4.8
EDA-202ENST00000374548 FBLN2P98095 1184 aa45.04■■■■■ 4.8
EDA-202ENST00000374548 TOP2BQ02880 1626 aa44.93■■■■■ 4.78
EDA-202ENST00000374548 CHD1O14646 1710 aa44.92■■■■■ 4.78
EDA-202ENST00000374548 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.91■■■■■ 4.78
EDA-202ENST00000374548 GRIN2BQ13224 1484 aa44.91■■■■■ 4.78
EDA-202ENST00000374548 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.91■■■■■ 4.78
EDA-202ENST00000374548 SYNJ1O43426 1573 aa44.9■■■■■ 4.78
EDA-202ENST00000374548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.9■■■■■ 4.78
EDA-202ENST00000374548 TRIM41Q8WV44 630 aa44.86■■■■■ 4.77
EDA-202ENST00000374548 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.85■■■■■ 4.77
EDA-202ENST00000374548 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.8■■■■■ 4.76
EDA-202ENST00000374548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
EDA-202ENST00000374548 PBRM1Q86U86 1689 aa44.74■■■■■ 4.75
EDA-202ENST00000374548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.72■■■■■ 4.75
EDA-202ENST00000374548 SYNJ2O15056 1496 aa44.65■■■■■ 4.74
EDA-202ENST00000374548 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.62■■■■■ 4.73
EDA-202ENST00000374548 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.62■■■■■ 4.73
EDA-202ENST00000374548 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.62■■■■■ 4.73
EDA-202ENST00000374548 ARHGEF11O15085 1522 aa44.56■■■■■ 4.72
EDA-202ENST00000374548 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.39■■■■■ 4.7
EDA-202ENST00000374548 ADAMTS12P58397 1594 aa44.35■■■■■ 4.69
EDA-202ENST00000374548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.35■■■■■ 4.69
EDA-202ENST00000374548 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.32■■■■■ 4.68
EDA-202ENST00000374548 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.31■■■■■ 4.68
EDA-202ENST00000374548 GRIN2AQ12879 1464 aa44.3■■■■■ 4.68
EDA-202ENST00000374548 ARAP1Q96P48 1450 aa44.17■■■■■ 4.66
EDA-202ENST00000374548 KIF27Q86VH2 1401 aa44.16■■■■■ 4.66
EDA-202ENST00000374548 NUP160Q12769 1436 aa44.09■■■■■ 4.65
EDA-202ENST00000374548 CEP170Q5SW79 1584 aa44.08■■■■■ 4.65
EDA-202ENST00000374548 IGF1RP08069 1367 aa44■■■■■ 4.63
EDA-202ENST00000374548 CUL7Q14999 1698 aa43.88■■■■■ 4.61
EDA-202ENST00000374548 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.78■■■■■ 4.6
EDA-202ENST00000374548 SHROOM2Q13796 1616 aa43.77■■■■■ 4.6
EDA-202ENST00000374548 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.77■■■■■ 4.6
EDA-202ENST00000374548 JPH4Q96JJ6 628 aa43.75■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms