Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms