Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 TUBB3-211ENST00000556536 925 ntTSL 321.58■■□□□ 1.051e-8■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 TUBB3-214ENST00000557490 806 ntTSL 519.66■□□□□ 0.741e-8■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 TUBB3-210ENST00000555810 767 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 TUBB3-202ENST00000553656 550 ntTSL 417.17■□□□□ 0.341e-8■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PAH-203ENST00000546844 705 ntTSL 315.5■□□□□ 0.071e-8■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PAH-210ENST00000550978 652 ntTSL 24.29□□□□□ -1.721e-8■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PAH-217ENST00000635500 189 ntTSL 31.69□□□□□ -2.141e-8■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 FGB-206ENST00000502545 1320 ntTSL 511.95□□□□□ -0.55e-18■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 FGB-201ENST00000302068 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.595e-18■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.415e-18■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 516.92■□□□□ 0.39e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.299e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.359e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-221ENST00000509148 888 ntTSL 212.34□□□□□ -0.439e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-233ENST00000514455 791 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.449e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 312.22□□□□□ -0.459e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 512.07□□□□□ -0.489e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 512.04□□□□□ -0.489e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.489e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.559e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.679e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 510.65□□□□□ -0.79e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.759e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-209ENST00000504128 990 ntTSL 210.34□□□□□ -0.759e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-216ENST00000507273 358 ntTSL 210.34□□□□□ -0.759e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RACK1-222ENST00000509535 456 ntTSL 310.34□□□□□ -0.759e-15■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 UPF1-212ENST00000601689 561 ntTSL 424.01■■□□□ 1.434e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 GALM-203ENST00000427858 597 ntTSL 419.12■□□□□ 0.654e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PTPRF-206ENST00000429895 6312 ntTSL 1 (best)18.82■□□□□ 0.64e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 GALM-205ENST00000444351 834 ntTSL 518.63■□□□□ 0.574e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PTPRF-215ENST00000496447 5887 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.174e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 515.98■□□□□ 0.154e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.084e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PTPRF-203ENST00000372407 4600 ntTSL 213.9□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 LARS-206ENST00000505223 582 ntTSL 313.64□□□□□ -0.234e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 GALM-201ENST00000272252 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 KDM4B-209ENST00000592159 411 ntTSL 311.94□□□□□ -0.54e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 LARS-216ENST00000618084 720 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.544e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.034e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 SEPT2-225ENST00000457874 484 ntTSL 37.52□□□□□ -1.214e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.364e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 SEPT2-236ENST00000476841 304 ntTSL 35.72□□□□□ -1.494e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 SRP68-208ENST00000588736 2532 ntTSL 211.73□□□□□ -0.533e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PSMB7-204ENST00000474081 546 ntTSL 57.87□□□□□ -1.153e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 PSMB7-205ENST00000478817 388 ntTSL 55.03□□□□□ -1.63e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-217ENST00000565845 750 ntTSL 521.75■■□□□ 1.072e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 517.79■□□□□ 0.442e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.322e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.162e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-14■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 ALYREF-204ENST00000512673 441 ntTSL 218.88■□□□□ 0.616e-7■□□□□ 8.1
G3BP1Q13283 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 519.49■□□□□ 0.713e-8■□□□□ 8
G3BP1Q13283 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-8■□□□□ 8
G3BP1Q13283 IGF2BP1-206ENST00000515586 768 ntTSL 317.64■□□□□ 0.413e-8■□□□□ 8
G3BP1Q13283 IGF2BP1-203ENST00000499130 568 ntTSL 315.3■□□□□ 0.043e-8■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.199e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 324.91■■□□□ 1.589e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.539e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 523.27■■□□□ 1.329e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.319e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.39e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.249e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 EXOSC10-209ENST00000485606 459 ntTSL 322.62■■□□□ 1.219e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.079e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.979e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 520.54■□□□□ 0.889e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.859e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 519.79■□□□□ 0.769e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.79e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 POLR2A-208ENST00000576952 532 ntTSL 218.94■□□□□ 0.629e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR18-205ENST00000590354 678 ntTSL 218.85■□□□□ 0.619e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 218.21■□□□□ 0.519e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 EXOSC10-207ENST00000474216 2007 ntTSL 217.52■□□□□ 0.399e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 WDR6-218ENST00000492780 537 ntTSL 217.13■□□□□ 0.339e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 216.66■□□□□ 0.269e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.219e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.099e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 PLCG1-220ENST00000617873 583 ntTSL 315.3■□□□□ 0.049e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 CHD7-211ENST00000532149 616 ntTSL 215.04■□□□□ -09e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 RRM2-210ENST00000498343 560 ntTSL 214.92□□□□□ -0.029e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC14.83□□□□□ -0.049e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-206ENST00000432591 802 ntTSL 514.01□□□□□ -0.179e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 HDLBP-242ENST00000488013 651 ntTSL 213.68□□□□□ -0.229e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.239e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-222ENST00000621863 1305 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.339e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 FUS-211ENST00000568901 521 ntTSL 212.85□□□□□ -0.359e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-213ENST00000463935 580 ntTSL 212.64□□□□□ -0.399e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.49e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 NUDT21-205ENST00000567110 607 ntTSL 212.24□□□□□ -0.459e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 CHD7-208ENST00000528280 566 ntTSL 211.9□□□□□ -0.59e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 AP2M1-218ENST00000480260 582 ntTSL 211.82□□□□□ -0.529e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 8
G3BP1Q13283 EXOSC10-201ENST00000304457 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.639e-7■□□□□ 8
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 388.9 ms