Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKS1Q9NXB0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKS1Q9NXB0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKS1Q9NXB0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKS1Q9NXB0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms