Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX18Q9NVP1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX18Q9NVP1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX18Q9NVP1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms